MAN 1 Magelang mempunyai fasilitas sarana dan prasarana yang sangat memadai untuk mendukung terlaksananya program dan kegiatan pendidikan di madrasah. Luasnya bisa mencapai 21.000 meter persegi

digunakan untuk Kantor Kepala Madrasah, Kantor Wakil Kepala Madrasah, Kantor Tata Usaha, Kantor Guru, Ruang BK, Ruang Kelas 50 ruang, Perpustakaan, Laboratorium IPA, Bahasa, Komputer, PAI, Masjid, Musholla, Asrama Putra, Asrama Putri, Aula PSBB, GOR, Lapangan Olahraga, Kantin, Koperasi, Kantor OSIS, DKA, UKS, Radio, KM-WC 30 ruang, Ruang Satpam, Tempat Parkir dan Taman.

Lahan komplek keterampilan seluas 6.450 meter persegi digunakan untuk Ruang Workshop Keterampilan 5 jurusan, Ruang Kelas 9 ruang, Musholla 1 ruang, Kantor 1 ruang, KM-WC 11 ruang, Rumah dinas Kepala Madrasah, Laboratorium IPA, Workshop Seni Budaya, Kantin, Ruang Satpam, Tempat Parkir dan Taman. Fotokopi Sertifikat terlampir.

Lahan baru hasil pinjam pakai dari lahan Eks Transito milik Pemkab Magelang seluas 4.386 meter persegi akan digunakan untuk sarana olahraga, karena dengan jumlah siswa 1790 masih memerlukan lahan lapangan olahraga yang cukup luas.